В начале октября 1941 года на подступах к Калуге начались кровопролитные бои.
С 12 октября по 30 декабря 1941 года город находился в оккупации немецко-фашистскими войсками. Лучшие здания захватчики приспособили под свои нужды. Не обошла эта горькая доля и наш техникум.
В Государственном архиве Калужской области сохранился документ следующего содержания:
"Калужский Горисполком т. Велогурову Зооветтехникум 9/II – 1942 г. №7
Калужский зооветтехникум препровождает перечень убытков, причиненных техникуму во время немецкой оккупации г. Калуги. Убытки выражаются в сумме 504 тысячи 500 рублей, причем большая часть их падает на учебные кабинеты и библиотеку. Целиком уничтожены (побиты, поломаны и испорчены) кабинеты химии, физики, зоологии, ботаники и общей частной зоотехники, механизации и пр., имевшие ценные приборы и реактивы. Частично уничтожен кабинет анатомии и физиологии.
Сохранилось имущество на 40%, кабинет патанатомии сохранился на 30%, кабинет микробиологии – на 60%, кабинет фармакологии – на 20%, кабинет акушерства и искусственного осеменения – на 40%.
На 80% уничтожена библиотека техникума, насчитывающая 40000 книг (ими немцы топили печи).
В общежитии техникума «культурные варвары» устроили конюшни для своих лошадей.
Уходя из Калуги, немецкие изверги в здании техникума испортили всё, что могли, выломав даже батареи центрального отопления и оставив на память о себе груды бумажного хлама .
Директор техникума Г.Алмазов Секретарь Т.Степанова"
6 июля 1943 года директор техникума Сигаев Владимир Сергеевич, бухгалтер Лимитовская Мария Герасимовна, председатель исткома профсоюза машинотракторных станций и земельных органов Степанова Татьяна Ивановна составили акт №45 об ущербе, причинённом немецко-фашистскими захватчиками и их сообщниками Калужскому техникуму животноводства и ветеринарии, находящемуся в Тульской области в г. Калуге по ул. Труда, д. 5.
«...В другом здании, где было общежитие студентов, немецкая армия заняла под склад и конюшню. Деревянный дом был разрушен бомбардировкой 26 февраля 1942 года. Всё имущество, которое находилось в техникуме уничтожено и растащено на сумму 701641 рубль».